用台語說台灣的歷史音檔
國是會議後，執政當局開始著手準備進行其所謂「一機關、兩階段修憲」工作。1991年(民國80年)4月8日，國民大會臨時會議揭幕。至21日，三讀通過制定「中華民國憲法增修條文」，並廢止「動員戡亂時期臨時條款」。4月30日，李登輝總統宣告，動員戡亂時期於5月1日零時起終止。同時公布「中華民國憲法增修條文」，廢止「動員戡亂時期臨時條款」。
「動員戡亂時期臨時條款」的廢除，說明著臺灣不再視中共政權為叛亂團體，結束對北京當局的敵對態度，甚至也可以說是承認中共政權的一個先決條件，這應該說是對北京當局一個善意的表示。
此外，「戡亂」的終止，也意味著台灣的政治要納入憲政常軌，在「法的最高位階」─憲法─之上，不該再有一個更高的特別法。而冠上「戡亂時期」頭銜的許多特別法(例如令人毛骨悚然的「戡亂時期檢肅匪諜條例」)，也將一併鬆綁。
刑法100條中尚有所謂「預備或陰謀」內亂罪之規定，仍予統治者有羅織人民入罪的機會，對人權還是一大威脅。1991年5月9日，調查局對於參加史明的「獨立台灣會」的陳正然、廖偉程等4名青年學生，以叛亂罪名逮捕，立刻引起社會各界及大學教授、學生的集體抗議。認為此案是解嚴以來最嚴重的侵害人權案件。學運團體發起「烽火遍地」，校園同步罷課靜坐抗議。5月12日，100多名大學教師和學生在中正紀念堂前靜坐示威。次日，文化界發起520請願遊行，要求廢止懲治叛亂條例及刑法100條。
1992年5月16日，立法院終於通過修正刑法100條，刪去該條文中有關預備或陰謀犯的規定。台灣的人權發展，又獲得一大進步。
在修正刑法100條的兩個半月後，1992年7月31日，扮演著特務政治角色之一的警備總司令部也予以裁撤。過去各機關內專門負責思想監控的「人二室」，也紛紛裁撤。台灣至此逐漸擺脫白色恐怖的陰影。人人可以自由討論各種不同的政治見解，不必擔心會遭逮捕。(參考資料：http://distance.shu.edu.tw/taiwan/CH29/CH29_SEC02.HTM)